МОУ средняя общеобразовательная школа №46 была сдана в эксплуатацию в 1953 году. Строилась для детей строителей Иркутской ГЭС и была одной из первых в будущем Свердловском округе.

 В 1999 году школе был присвоен статус муниципального учреждения среднего (полного) общего образования.

В настоящее время, на основании Постановления мэра г. Иркутска от 16.06.2011г. №031-06-1067/11, школа имеет статус:  "Муниципальное бюджетное общеобразовательное учреждение города Иркутска средняя общеобразовательная школа № 46"