Школа № 12 является общеобразовательным учебным заведением. Официально функционирует как государственное образовательное учреждение  с 01 сентября 1962 года, с 2011 года в статусе «Муниципальное автономное общеобразовательное учреждение города Калининграда средняя общеобразовательная школа № 12». С 8 августа 2023 года МАОУ СОШ №12 реорганизована путём присоединения к ней МАОУ СОШ №16.