История учреждения начинается с 1980 г., когда появляется средняя школа № 15. С 01.09.1997 г. средняя школа № 15 реорганизована в муниципальное образовательное учреждение гимназию № 6. С 27.11.2015 г. гимназия переименована в муниципальное бюджетное общеобразовательное учреждение г. Мурманска «Гимназия № 6».

Главная стратегическая цель гимназии – обеспечение условий для непрерывного инновационного развития гимназии, удовлетворения потребностей участников образовательных отношений в качественном образовании через формирование и использование инновационной образовательной среды как основного фактора модернизации гимназического образования и инструмента управления инновационной деятельностью Учреждения.