ТОГБОУ «Центр лечебной педагогики и дифференцированного обучения» создано 21 июля 2008 года путём слияния ТОГОУ «Специальная (коррекционная) общеобразовательная школа»; ТОГОУ «Специальная (коррекционная) общеобразовательная школа- интернат №3 VIII вида»; ТОГОУ «Специальный (коррекционный) детский дом для детей с отклонениями в развитии №6» и является их правопреемником.