МАОУ гимназия № 26 г. Томска была открыта в 1986 году.

За время своего существования она прошла интересный путь становления.

• В 1993 году школа получила статус муниципальной гуманитарно-экономической гимназии.
• В 2001 году прошла государственную аккредитацию и аттестацию и была переименована в муниципальное общеобразовательное учреждение гимназию № 26 г. Томска. В 2012 году гимназия была переименована в муниципальное бюджетное общеобразовательное учреждение гимназию № 26 г. Томска.
• В 2013 году стала муниципальным автономным общеобразовательным учреждением гимназией № 26 г. Томска.