Лицей №40 при УлГУ (ранее школа №40) был основан в 1953 г. Лицей размещается в типовом здании, построенном в 1971 году. В 2002 году по распоряжению мэра города Ульяновска № 1018-р от 02.08.2002 школа переименована в муниципальное общеобразовательное учреждение "Лицей физики, математики, информатики № 40" при Ульяновском государственном университете. 21.03.2018г. лицей переименован в муниципальное бюджетное общеобразовательное учреждение города Ульяновска "Лицей № 40 при Ульяновском государственном университете" (Лицей № 40 при УлГУ).